La tomographie par projection optique (OPT) utilise des méthodes de reconstruction similaires à l'imagerie par rayons X en TDM, mais avec de la lumière visible pour l'observation de micro-échantillons. En prenant des centaines de photos d'un échantillon sous tous les angles de rotation, une représentation 3D de cet échantillon peut être obtenue avec la précision et la clarté des microscopes traditionnels, sans nécessiter de sectionnement physique destructif.
Il existe de nombreuses façons de le faire, mais dans un souci de simplicité et d'économie, j'ai opté pour l'approche la plus basique possible pour commencer, ce qui a abouti à un appareil performant coûtant environ 60 $. Le matériel comprend : un microscope USB (20 $), un miroir (1 $), un moteur pas à pas (15 $), un pilote de moteur pas à pas EasyDriver (7 $), une LED de 10 W (8 $), un convertisseur de
Le code Matlab est ici :https://drive.google.com/file/d/1b-BmD_G1TKKAKyeW1MWYgqi3KEwDDZLn/view?usp=share_link
Le code Matlab effectue une quantité incroyable de travail ici, et il fait tout en un clic, de l'acquisition aux calculs de projection réels. À condition que votre échantillon soit correctement aligné dans le cadre de l'image, cela devrait donner des résultats assez bons dès que vous définissez vos seuils dans le visualiseur.
Étapes pour exécuter :
- Installez le firmware d'Arduino.
- Installez le module complémentaire du Pack de reconstruction CT de Matlab (https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/35548-3d-cone-beam-ct--cbct--projection-backprojection-fdk--iterative-reconstruction-matlab-examples)
- Changer le port COM dans le script Matlab en fonction du port actuel de votre Arduino.
- Activate or disable CUDA in the Matlab script if you don't have an Nvidia graphics card.
- Centrez et focalisez votre échantillon de choix exactement au centre du cadre de la caméra.
- Cliquez sur "Exécuter".
- Attendez un peu.
- Activate Volume 1
- Activatez un paramètre de rendu.
- Rendez le rendu 3D résultant aussi transparent que possible jusqu'à ce que vous n'obteniez que les parties de la reconstruction que vous souhaitez.
J'ai posté ceci ici dans l'espoir que quelqu'un, quelque part, puisse en tirer du plaisir ou, mieux encore, une utilisation productive d'un microscope 3D bon marché. Si c'est vous et que vous avez des commentaires ou des questions, n'hésitez pas à me contacter ici dans la section des commentaires et je ferai de mon mieux pour vous aider.
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