Zusammenfassung
"Eine DNA-Klammer, auch bekannt als Gleitklammer, ist eine Proteinfaltung, die als Prozessivitätsfördernder Faktor bei der DNA-Replikation dient."
--http://en.wikipedia.org/wiki/DNA_clamp
Clamp-Loader sind Proteinkomplexe, die Clamps öffnen und sie auf DNA laden. Hier werden die Teile bereitgestellt, um ein Modell des Bakteriophagen T4-Clamp-Loaders zu erstellen, der an Nukleinsäure und eine offene Clamp gebunden ist. Weitere Informationen hier:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3281585/
Die Modelle sind Oberflächendarstellungen, die aus dem PDB-Eintrag 3U60 abgeleitet wurden:
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=3u60
STL-Dateien, die mit VMD erstellt wurden:
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
Anweisungen
Erfolgreich in PLA hergestellt von einem Replicator 2 mit MakerWare 2.2.2.89. Standardauflösung, 25% Füllung, 3 Schalen, Raft und Stützen.
Drucken Sie jeweils eine Kopie von sieben bereitgestellten STL-Dateien.
Es ist schwierig, die Teile des Modells zusammenzufügen. Zur Unterstützung werden eine PDB- und eine VMD-Datei bereitgestellt, die zur Visualisierung des Komplexes verwendet werden können. Legen Sie die PDB- und VMD-Dateien in demselben Verzeichnis ab und öffnen Sie die VMD-Datei. Die Teile können mithilfe von PVA-Kleber zusammengefügt werden.
Die VMD-Software kann hier bezogen werden:
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
Sowohl in der VMD-Datei als auch in den bereitgestellten Bildern sind die Modelle entsprechend gefärbt:
3U60-A_fixed.stl weiß
3U60-B_fixed.stl orange
3U60-C_fixed.stl gelb
3U60-D_fixed.stl blau
3U60-E_fixed.stl grün
3U60-NA_fixed.stl rot
3U60-Klemme_fest.stl magenta
Etiketler
Model Kaynağı
