Перенесите файлы SVG в Prusa Slicer (не на платформу (для позиционирования в центре)), в открывшемся меню укажите глубину каждого файла SVG, настройте слой для изменения цвета.

--ВАЖНО--
Выберите две модели и нажмите "Объединить" (чтобы избежать повторного заполнения одного слоя).