Resumé
"Une pince à ADN, également appelée pince glissante, est un repliement de protéine qui sert de facteur favorisant la processivité dans la réplication de l'ADN."
--http://en.wikipedia.org/wiki/DNA_clamp
Les chargeurs de pinces sont des complexes protéiques qui ouvrent les pinces et les chargent sur l'ADN. Voici les pièces pour fabriquer un modèle du chargeur de pince T4 du bactériophage lié à l'acide nucléique et à une pince ouverte. Plus d'informations ici :
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3281585/
Les modèles sont des représentations de surface dérivées de l'entrée PDB 3U60 :
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=3u60
Les fichiers STL créés à l'aide de VMD :
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
Instructions
Fabriqué avec succès en PLA par un Replicator 2 en utilisant MakerWare 2.2.2.89. Résolution standard, 25% d'infill, 3 coquilles, raft et supports.
Imprimez une copie de chacun des sept fichiers STL fournis.
Il est difficile d'assembler les pièces du modèle. Pour vous aider, un fichier PDB et VMD est fourni, qui peut être utilisé pour visualiser le complexe. Placez les fichiers PDB et VMD dans le même répertoire et ouvrez le fichier VMD. Les pièces peuvent être fixées ensemble à l'aide de colle PVA.
Le logiciel VMD peut être obtenu ici :
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
Dans le fichier VMD et les images fournies, les modèles sont colorés en conséquence :
3U60-A_fixed.stl blanc.
3U60-B_fixed.stl orange
3U60-C_fixed.stl jaune.
3U60-D_fixed.stl bleu.
3U60-E_fixed.stl vert.
3U60-NA_fixed.stl rouge.
3U60-Clamp_fixed.stl magenta
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モデルソース
