Оптическая проекционная томография (OPT) использует методы реконструкции, аналогичные КТ-рентгеновской визуализации, но с использованием видимого света для микроскопических образцов. Снимая сотни фотографий образца под разными углами поворота, можно получить его 3D-изображение с такой же четкостью и разрешением, как у традиционных микроскопов,
Есть много способов сделать это, но ради простоты и экономии я выбрал самый базовый подход, в результате чего получил эффективное устройство стоимостью примерно 60 долларов. Установка состоит из: USB-микроскопа (20 долларов), зеркала (1 доллар), шагового двигателя (15 долларов), драйвера шагового двигателя EasyDriver (7 долларов), светодиода 10
Код Matlab здесь:https://drive.google.com/file/d/1b-BmD_G1TKKAKyeW1MWYgqi3KEwDDZLn/view?usp=share_link
Код Matlab выполняет здесь невероятно большой объём работы и делает всё одним кликом, от получения данных до фактических вычислений проекции. При условии, что ваш образец правильно выровнен в кадре изображения, это должно сразу же дать довольно хорошие результаты, как только вы установите свои пороговые значения в визуализаторе.
Шаги для запуска:
- Установите прошивку Arduino.
- Установите дополнение для пакета реконструкции КТ в Matlab (https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/35548-3d-cone-beam-ct--cbct--projection-backprojection-fdk--iterative-reconstruction-matlab-examples)
- Измените COM-порт в скрипте Matlab на текущий порт вашего Arduino.
- Включите или отключите CUDA в скрипте Matlab, если у вас нет видеокарты Nvidia.
- Поместите выбранный вами образец точно в центр кадра камеры и сфокусируйтесь на нём.
- Нажмите "Запустить".
- Подожди немного.
- Включите Громкость 1.
- Включите настройку рендеринга.
- Отрегулируйте порог полученного 3D-рендеринга, пока не получите только те части реконструкции, которые вам нужны.
Я разместил это здесь в надежде, что кто-то где-то сможет получить удовольствие или, ещё лучше, эффективно использовать недорогой 3D-микроскоп. Если это вы, и у вас есть комментарии или вопросы, пожалуйста, не стесняйтесь связаться со мной здесь в разделе комментариев, и я сделаю всё возможное, чтобы помочь.
Tags
Source du modèle
