まとめ
滑りクランプとも呼ばれるDNAクランプは、DNA複製においてプロセス性を促進する因子として機能するタンパク質構造です。
--http://en.wikipedia.org/wiki/DNA_clamp
クランプローダーは、クランプを開き、DNAにクランプをロードするタンパク質複合体です。ここでは、核酸と開いたクランプに結合したバクテリオファージT4クランプローダーのモデルを作るためのパーツが提供されています。詳細はこちら:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3281585/
これらのモデルは、PDBエントリ3U60から派生した表面表現です。
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=3u60
VMDを使用して作成されたSTLファイル:
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
指示書
MakerWare 2.2.2.89を使用したReplicator 2でPLAで成功して製造されました。標準解像度、25%のインフィル、3つのシェル、ラフト、サポートが使用されています。
提供された7つのSTLファイルのそれぞれを1枚ずつ印刷してください。
モデルのパーツを組み合わせるのは難しいです。助けになるように、PDBとVMDファイルが提供されており、これらを使って複合体を可視化することができます。PDBとVMDファイルを同じディレクトリに置き、VMDファイルを開きます。PVA接着創を使ってパーツを固定することができます。
VMDソフトウェアはこちらから入手できます。
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
VMDファイルと提供された写真の両方で、モデルはそれに応じて着色されています。
3U60-A_fixed.stl 白
3U60-B_fixed.stl オレンジ
3U60-C_fixed.stl 黄色
3U60-D_fixed.stl ブルー
3U60-E_fixed.stl グリーン
3U60-NA_fixed.stl 赤
3U60-Clamp_fixed.stl マゼンタ
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