总结
DNA 夹钳,又称滑动夹钳,是一种蛋白质折叠结构,在 DNA 复制过程中起促进复制效率的作用。
--http://en.wikipedia.org/wiki/DNA_clamp
钳子装载器是由蛋白质复合物组成的,它们能够打开钳子并将其装载到DNA上。本文提供的材料可用于制作细菌噬菌体T4钳子装载器与核酸结合及钳子打开状态的模型。更多信息请点击此处:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3281585/
这些模型是基于PDB条目3U60生成的表面结构展示图:
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=3u60
使用 VMD 创建的 STL 文件:
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
操作指南
使用MakerWare 2.2.2.89软件,通过Replicator 2打印机成功打印出PLA材质模型。打印参数设置为标准分辨率,25%填充率,3层外壳,使用了支撑结构和打印平台。
请将提供的七个STL文件各打印一份。
将模型各部件拼合在一起颇具挑战性。为提供帮助,我们提供了PDB和VMD文件,可用于可视化该复合物。请将PDB和VMD文件放在同一目录下,并打开VMD文件。各部件可使用PVA胶水进行固定拼合。
虚拟机监控程序
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
无论是在VMD文件中,还是在提供的图片中,模型都被相应地进行了颜色标注:
3U60-A_fixed.stl 白色款
3U60-B_fixed.stl 橙色版本
3U60-C_fixed.stl 黄色版本
3U60-D_fixed.stl 蓝色版本
3U60-E_fixed.stl 绿色版本
3U60-NA_fixed.stl 红色版本
3U60夹具_固定版.stl 品红色
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