まとめ
難易度:上級(最後に免責事項をご覧ください)。
私が使用した部品やアプローチ、これまでの結果を列挙しておきました。このプロジェクトは、より高度なセットアップを検討したい方々にとって検討する価値がある段階に来ていると思います。これはInstructableから発展してきました。http://www.instructables.com/id/Coffee-Cup-PCR-Thermocycler-costing-under-350/
また、BioHackingの説明ウェブページをご覧いただけるかもしれません、そこはこちらです。http://en.wikipedia.org/wiki/BiohackingそしてオープンPCRでの素晴らしい作品。http://openpcr.org/
このモジュールの3Dプリンテッドエンクロージャーを探索することが目的です。可能性はほとんど無限です。私はCADで設計した新しいエンクロージャーデザインを迅速に印刷することができます。この情報があなたのアプローチに役立つことを願っています。
このプロジェクトでは、3Dプリンタで印刷し、USBで給電し、リモートアクセスし、使い捨て、低コストのリアルタイム定量PCR(qPCRまたはRTPCR)モジュールを構成することを目的としています。
背景:
ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)は、法医学、医学、生物学、現場調査といった多くの分野に革新をもたらしました。残念なことに、PCR手順中にDNAサンプルの増幅を追跡して表示できるリアルタイム(RT)PCRプラットフォームは、依然として非常に高価です。220ドル以下で3D印刷された低コストのUSB給電式リモートアクセスシステムを開発することは、研究、医学、
このプロジェクトが面白いのは何でしょうか?
1.教育や研究に大きな影響を与える幅広い応用範囲。
2.斬新な3D印刷可能なデザインの特徴
3.低コスト技術の組み合わせ
4.研究技術へのアクセス提供
- フィールド調査用の頑丈なシステム。
このプロジェクトのユニークな側面は、低コストのポータブルRT-PCRモジュールの開発は、多くのレベルや教育アプリケーションにわたって行われることです。これらは、高校のプログラムで若い科学者の育成から、大学院環境における分子生物学研究室での手頃な価格の教育機能、大学院の研究室、そして頑丈でポータブルな現場研究アプリケーションに至るまでです。
目的は、220ドル以下でポータブルなUSB電源のRT-PCRモジュールを提供し、教育コンテンツと組み合わせてこの構成を提供することです。これはバイオ医薬品企業と協力して行う可能性があります。
目的は、このシステムを学術プログラムのための手頃な価格で提供するだけでなく、バイオメディカル、環境、現場研究の設定で使用するためにモジュールを「強化」することです。
理想的には、このユニットはパララックスのベーシックスタンプモジュール、液晶画面、ミンティブースト電源で動作するはずです。
初期テストでは、スタイロフォームの断熱材なしでも十分な熱サイクルが実現し、熱サイクルに基づいて適切なタイミングで光量をモニターできることが示されました。
ラブビューのグラフィカルソフトウェアプラットフォームでは、機能を微調整したり、高級ユーザーインターフェイスを開発したりすることが簡単にできます。私は現在、別のグラフで温度読み取りに基づいて光センシングキーを微調整しています。
免責事項:これは私の経験です。私はあなたに何をすべきかを教えることではなく、私がしたことを教えるだけです。もしあなたがこれを試みてコンピュータが壊れたら、それはあなたの責任です。マジで、その部分を意味しています。このプロジェクトは、3Dプリンタで低コストのRT PCRの機能を探索することを目的としており、診断や現場研究の目的ではありません。教育的、指導的、または例示
指示書
現在のプロジェクトのフェーズ: プロジェクトは「進行中」です。現在、LabVIEWで光レベルセンシングを書いていますが、これは周期温度に基づくもので、別途光レベルグラフとデータロギングをTXTファイルに行っています。より敏感な光センサー、例えばPMT(光電子増倍管)を探したいと思っていますが、USB電源のみで対応したいと思っています。Phidgetの
説明と部品リスト:
1) 電子部品を組み立てる。
2) LABVIEWで制御プログラムを書く(または液晶画面付きのBasic Stampモジュール)。
3) モジュール用の3Dハウジング/エンクロージャーを印刷する(蓋付きの六角形の箱)。
3) LED用のドリルホール、上部のサンプルチューブ用のドリルホール、そしてバンドパスフィルターホルダーが収まるホール。
バンドパスフィルターは、サンプルとフォトレジスターの間に位置し、フォトレジスターの上に配置されています。
4) いくつかの素晴らしい実験をしてください。
- 注意してください。0.2mlのPCRチューブが最上部のサンプルホールにあるとき、LED光がチューブに斜めに照射され、BANDパスフィルターはLEDビームの直接の照射範囲外にあります。六角形の内部角度は120度です。これらの角度は、ミンコ・サーモフォイルヒーターがエンクロージャの前面と背面にある間にサンプルチューブに収束します。
部品リスト:
- 温度センサー [1051_2 - PhidgetTemperatureSensor 1-Input 60$]
- 熱電対 [3109_0 - TPK-01GビーズプローブK型(-50℃~+450℃)12ドル]
- ヒーター [ミンコヒーター 低電圧 [MINCO HK5561R37.4 L12B 0021 2つEbayで25ドル]
- ケーブル類 [以前のプロジェクトからの古いUSBケーブル - 無料]
- リレー [3053_0 - デュアルSSRリレーボード 30ドル]
- フォトレジスタ [eBayで2ドルで満タンの袋]
- ファジェット電圧分割器 [1121_0 - 電圧分割器 7ドル] 調整可能な感度
- バンドパスフィルター [エドムンド・オプティクス フィルター INT 532または535 nm 直径11.80 mm 25ドル]
- 制御プログラム [Labview]
- 2/2/2 2デジタル入力、2デジタル出力、2アナログ入力ボード[1011_0 - PhidgetInterfaceKit 2/2/2 50ドル]
- LED [SYBERの緑色蛍光用の波長を発する(アクア497)。数個で10ドルです。]
赤外線LEDも使えることに注意してください。ただし、それにはいくつかの副ピークが伴う可能性があります。
部品の総コストは50+25+1+30+25+12+60+2+10=215ドルです(LABVIEWや3Dプリンタは含まれていません)。
- もし3DプリンタやLabviewのグラフィカルプログラミングプラットフォームをお持ちでない場合は、電源としてAltoid Minty Boost(30回の熱サイクルに適しています)と、液晶画面を備えたParallax Board of Education(Basic Stamp)を使用することを検討してください。プログラミングは簡単ですが、「全局観」を念頭に置きながら、黒板にBASICプログラムで実現したい機能を描き
免責事項:これは私の経験です。私はあなたに何をすべきかを教えることではなく、私がしたことを教えるのです。もしあなたがこれを試みてコンピュータが壊れたら、それはあなたの責任です。マジで、その部分を意味しています。このプロジェクトは、3Dプリンタで低コストのRT PCRの機能を探索することを目的としており、診断や現場調査の目的ではありません。教育的、指導的、または例示
Tags
Modellquelle
